该实验室建筑面积150平方米，拥有PCR分析仪、多功能电泳仪、水平板电泳槽、垂直板电泳槽、凝胶成像系统、蛋白质核酸测定仪、高速冷冻离心机、分子杂交箱、酶标仪、超低温冰箱、分析天平、智能生化培养、恒温振荡培养箱、高级生物显微镜、水浴摇床等进口仪器和设备33台（套）。该实验室可进行苹果等果树的生长性状、品质性状和抗逆性状的改良研究；果树功能基因克隆、定位和表达分析研究；分子标记辅助选择育种研究；果树种质资源的亲缘关系鉴定与分析；果树病毒脱除与鉴定、检测研究；苹果细胞工程生物技术育种研究；果树的组织切片及细胞和染色体显微观察等研究工作。
